高速离心机和低速离心机较主要的区别在于它们的转速不同。低速离心机的转速较慢，一般在8000rpm以下，大部分是3000~5000rpm；而高速离心机则是转速较高的离心机，普遍转速在10000rpm以上，有的甚至可达30000rpm。

另外，高速离心机和低速离心机的适用范围也有所不同。低速离心机除应用在纺织、化工、环保等传统行业外，现在大量的应用于制药企业，以实现母液的分离。而高速离心机则广泛用于生产工艺之外，现在也大量应用于实验室设备。